Bueno,en realidad ahora lo que he hecho ha sido otra cosa,pero parecido a lo que comenta Empardopo
He cogido y desde el menu de mame,he localizado todos los juegos..por ejemplo de CPS1,asi que he ido mirando el nombre de cada ROM,lo buscaba en la carpeta y lo dejaba aparte en otra carpeta.Cuando he acabado de apartar todas las roms de CPS1,desde AM,lo que he hecho ha sido en los directorios,especificar la carpeta de destino de las ROMS,pero el ejecutable el del MAME 201 y los marquees,videos y demas cosas he indicado las carpetas de mame,de ese modo tengo un listado de MAME,otro de CPS1,CPS2,CPS3,NEOGEO y CAVE separados pero todos se ejecutan desde el mame.Asi solo necesito un emulador en vez de usar uno para cada sistema y solo he de configurar todo una vez.El tema de bezels y filtros HSLS ahora lo tengo en todo ya que como todos se ejecutan desde mame pues ya no tengo el problema de tener que buscar como poner scanlines o filtros en cada emulador