yo lo que hago es en la carpeta base (por ejemplo "F:\ROMS\MUGEN\Juegos") crear una carpeta para cada juego y luego en la carpeta base hago un acceso directo al ejecutable de cada juego renombrado con el nombre que quiero que salga en MALA (pq a veces el ejecutable se llama simplemente mugen jeje).
luego en MALA le pasas la ruta de la carpeta base como directorio de roms y como extension LNK
como ejecutable no pones nada
y en el command line le pasas "%rom%"
Lo mismo para OpenBOR o cualquier tipo de juegos de PC