A ver si entiendo, ¿hablan de los CHD de mame (Compressed Hunk of Data)? Si es así, entonces hay algo que no me cuadra con la respuesta de Cholfo, los CHD son simplemente imágenes comprimidas con un formato especial, no archivos dentro de una imagen.
En otras palabras, esos CHD no son diferentes en concepto a un BIN o un ÏSO, solo cambia el formato de compresión, eso si, siempre y cuando estemos hablando de los CHD de mame, que no sé si los cd neogeo CD son los mismos o si es una coincidencia de nombre.
Bad_boo, el programa CHDMAN, hasta donde tengo entendido es una herramienta para manejar archivos CHD, pero no soporta ni los BIN o los ISO (hasta donde tengo entendido), para que me entiendas, imagen que estás de regreso en los 90 y quieres convertir un archivo .RAR en un .ZIP, para hacer eso, necesitas 2 programas, uno para descomprimir el .RAR (winrar por ejemplo) y otro para recomprimir los archivos a .ZIP (winzip por ejemplo).