El te crea una lista a raíz de lo que tenga en el directorio , ¿no? AL menos es lo que me hizo a mi? NO se si vi la opción favoritos.
Por lo que he probado, la lista que crea se usa para almacenar información extra como la imagen que quieras usar para esa rom, pero no para determinar si se debe o no se debe mostrar dicho archivo en el listado, por ejemplo.
Si tengo 10 rom y 2 bios (12 archivos .zip en total) en una carpeta, el emulstation siempre me muestra 12 "juegos" en la lista, independiente de que solo tenga 10 en el XML.
Los 10 juegos se mostraran con su imagen información, todo bien, pero en la lista para seleccionar igual salen las 2 bios.