El programa que yo tengo es para pasar .gdi de dreamcast a .chd, aunque no recuerdo si también admite .cdi a chd.
No creo que todos los emuladores admitan chd+cue, aunque sí te puedo orientar como comprimo los juegos en cd/dvd de diferentes sistemas para ahorrar muchísimo espacio.
- Dreamcast los paso a .chd con Dreamcast GDI to CHD.
- Para PSX los cue+bin los paso a PBP con psx2psp_v.1.4.2.
- Para PSP los paso a .cso con Yacc.
- Para PS2 uso maxcso_1.7.2, ojo, este pasa los juegos a formato .cso pero uno especial para el emulador pcsx2, no tiene nada que ver con el formato .cso para PSP.
- Para Sega CD/Mega CD uso varios programas y los convierto en iso+ogg (se reducen una barbaridad, Mikey Mania 63.5mb, Snatcher 162mb, Sonic CD 164mb... ).
- Para Gamecube & Wii los comprimo en .gcz con el emulador dolphin, algunos juegos ahorran muchísimo espacio.
Si puedo ayudarte con alguno de estos sistemas o necesitas alguno de estos programas, solo tienes que comentar.
Un saludo.