Yo cuando empiezo a configurar desde el principio hago lo siguiente:
1º)Inicio Retroarch,cambio a
configuracion por core y que se autoguarde al cerrar Retroarch.
2º)
Configuro los botones del Joystick (arriba,abajo,izquierda,derecha,aceptar y volver)
Cierro Retroarch (se habra guardado)
3º)
Abro Retroarch de nuevo y empiezo a hacerlo todo
con el Joystick,
cargo un core (ejemplo
snes9x),elijo una
rom a cargar y me reconoce las direcciones.Con el emulador iniciado
accedo al menu Retroarch para terminar de configurar los botones (Start,select,etc),
vuelvo al juego y
compruebo que
funciona.
Cierro Retroarch,quedara
el core guardado.
4º)Lo mismo que el 3º.
5º)Lo mismo que el 3º.
Asi hasta terminar de configurar todos.
Espero que te sirva,saludos.